根據(jù)病原菌對治療的反應(yīng)、合并癥和并發(fā)癥可以做出抗菌療程的決定,一般抗生素的療程為7到10天。軍團(tuán)菌肺炎支原體和衣原體所致的肺炎,可能應(yīng)該抗菌治療至少2周。臨床癥狀明顯好轉(zhuǎn)但其影像學(xué)吸收要延遲,尤其對于患者的年齡和有無并發(fā)癥,是決定肺炎恢復(fù)速度的重要因素。年齡小于50歲的肺炎球菌肺炎患者雖然伴有菌血癥,其胸片上的浸潤陰影可在四周內(nèi)消散,但老年患者或有基礎(chǔ)疾病以及重癥肺炎患者的速度恢復(fù)顯著減慢,只有20%到30%的患者胸片表現(xiàn)可在4周時消散。軍團(tuán)菌感染的肺部陰影消散時間則更長,只有55%的病例能在12周時完全消除,對于大于40歲或吸煙的某些患者,建議胸片隨診的時間是在抗菌治療后的7到12周。